Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLF1Q9BQI6 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLF1Q9BQI6 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms