Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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