Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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CLIP4Q8N3C7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CLIP4Q8N3C7 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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