Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HECW1Q76N89 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms