Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ATG16L1Q676U5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms