Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TDRD12Q587J7 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms