Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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TRIM71Q2Q1W2 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM71Q2Q1W2 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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