Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COL4A6Q14031 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
COL4A6Q14031 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COL4A6Q14031 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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COL4A6Q14031 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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COL4A6Q14031 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COL4A6Q14031 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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