Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CUL4BQ13620 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CUL4BQ13620 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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