Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ST3GAL6-228ENST00000613264 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF180-201ENST00000221327 4335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRO-202ENST00000319167 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FGF23-201ENST00000237837 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC106865.1-201ENST00000602666 3034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FER1L6-AS1-201ENST00000518567 2315 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRPF40B-202ENST00000380281 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DYNC1I1-204ENST00000437599 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MEG3-214ENST00000519709 1726 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 OVOL1-201ENST00000335987 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CRBN-215ENST00000639284 2223 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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