Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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FOXF1Q12946 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FOXF1Q12946 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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