Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
FMODQ06828 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
FMODQ06828 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms