Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARID5AQ03989 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms