Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
DSC2Q02487 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms