Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms