Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ACTG2P63267 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.1 ms