Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 GLB1L-203ENST00000409640 2042 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CEACAM20-203ENST00000614924 1809 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPL23P62829 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 MCL1-204ENST00000620947 3626 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPL23P62829 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms