Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GSCP56915 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 KRT42P-202ENST00000438131 2895 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC016738.1-201ENST00000452364 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GSCP56915 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GSCP56915 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GSCP56915 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms