Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GOLGA6L4-202ENST00000422563 4155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SH3BGRP55822 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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