Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 C12orf45-205ENST00000622317 1078 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CRCT1-201ENST00000368790 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PSMA7-202ENST00000370861 773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC104115.1-201ENST00000484005 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 AC027279.2-201ENST00000561938 793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BRCA2P51587 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms