Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC136475.7-201ENST00000602949 592 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SMARCA4P51532 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AL450346.2-201ENST00000495602 1024 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC134878.2-201ENST00000620700 1265 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMARCA4P51532 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms