Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 RBP1-201ENST00000232219 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AL357558.2-201ENST00000431915 425 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 AC010601.2-201ENST00000623060 774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NESP48681 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AKR1C6P-201ENST00000432950 983 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AC009132.1-201ENST00000565194 320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NESP48681 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 ST3GAL1P1-201ENST00000513810 1014 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 ZNF720-211ENST00000539915 837 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC090950.1-202ENST00000605733 644 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NESP48681 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NESP48681 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 AL138885.2-201ENST00000420389 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NESP48681 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms