Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GJC1P36383 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GJC1P36383 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GJC1P36383 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms