Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 C3orf84-203ENST00000545770 706 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POLR2AP24928 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms