Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SHROOM2P1-201ENST00000434773 2384 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 NUF2-201ENST00000271452 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 IL1RAP-211ENST00000439062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DBIL5P-203ENST00000536214 2677 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
CXCL2P19875 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms