Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC9A1P19634 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms