Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms