Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TCP1P17987 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TCP1P17987 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TCP1P17987 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms