Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
XBP1P17861 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
XBP1P17861 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms