Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATP2A2P16615 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms