Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms