Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
DKK2Q9UBU2 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
DKK2Q9UBU2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms