Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TFIP11Q9UBB9 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms