Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms