Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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CALCOCO1Q9P1Z2 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 LHCGR-201ENST00000294954 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CALCOCO1Q9P1Z2 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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