Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM5Q9C035 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms