Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
NICN1Q9BSH3 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
NICN1Q9BSH3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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