Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MYRIP-201ENST00000302541 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TLK1-205ENST00000431350 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ESR1-207ENST00000440973 6466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
RETNLBQ9BQ08 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms