Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TUBGCP5Q96RT8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TUBGCP5Q96RT8 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms