Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.3 ms