Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
COG3Q96JB2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COG3Q96JB2 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms