Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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UBXN4Q92575 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBXN4Q92575 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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