Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLHDC9Q8NEP7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC9Q8NEP7 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms