Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF148Q8N7C7 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms