Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
VPS8Q8N3P4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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