Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC84Q86UT8 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms