Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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