Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PITRM1-201ENST00000224949 3450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 BCKDK-204ENST00000394951 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SZRD1-201ENST00000401088 3636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LSAMPQ13449 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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