Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-211ENST00000503485 6768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TDRD9-202ENST00000409874 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 COL3A1-201ENST00000304636 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PCCB-210ENST00000471595 6090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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