Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPP3CAQ08209 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms